数据获取
下载与引用
下载变体、测量和来源数据,按研究问题选择相应数据表。测量指标、蛋白版本和原始来源随记录保留。
整理后的研究资料数据
各类测量指标严格分离。人工品尝、细胞受体、结构稳定性与计算结果 请按测量方法分别比较。这些数据经过统一编号、蛋白版本和实验条件整理,方便查询和下载;每行保留原始来源。
| 数据集 | 说明 | 记录数 | 操作 |
|---|
完整数据表
下面的 CSV 按数据库原始字段完整导出,不省略列;
\N 表示数据库空值,空字段则保留真实空字符串语义。
| 表 | 说明 | 行数 | 操作 |
|---|
仓库内文件
bvk/data/curated/*.csv- 整理后的记录(脚本生成,请勿手工编辑)
bvk/database/bvk.sqlite- SQLite 数据库,含按测量指标分开的整理数据
bvk/site/data/bvk.json- 网页数据(本页所有内容的来源)
bvk/schema/data_dictionary.md- 数据字典:字段定义与标准数据使用条件
bvk/schema/controlled_vocabularies.yaml- 受控词汇、设计硬约束、FTO 分级
bvk/schema/schema.sql- SQLite 表结构与视图定义
bvk/data/raw/structures.sha256- 参考结构文件校验和清单
重建全部产物
bash
python bvk/scripts/build_seed_bvk.py
python bvk/scripts/validate_schema_contract.py
python bvk/scripts/validate_bvk.py
python bvk/scripts/build_database.py
python bvk/scripts/download_structures.py
python bvk/scripts/download_structures.py --verify
python bvk/scripts/build_site.py
python bvk/scripts/verify_site.py
python bvk/scripts/sync_release_metadata.py
python bvk/scripts/verify_site.py
python bvk/scripts/validate_field_roundtrip.py
python bvk/scripts/validate_bvk_release.py